返回 AI 工具目录
genomoncology/biomcp
MCP 服务人工精选最近核验 2026年7月23日
BioMCP 是一个开源的生物医学数据访问工具,同时提供命令行与 MCP 服务器,用统一的查询语法接入约三十个公开生物医学数据源,让研究者和 AI 智能体无需分别学习各家 API。它支持跨 PubTator3、Europe PMC 的文献检索与去重,可在基因、变异、药物、疾病、通路之间切换检索,并接入 ClinicalTrials.gov、ClinVar、gnomAD、OncoKB、OpenFDA 等来源。以 Rust 与 Python 编写,采用 MIT 许可,支持二进制、PyPI、Homebrew、Docker 及 stdio 或 HTTP 方式运行。
定价开源部署本地运行、自托管国内可达国内可达性待核验
解决什么问题
- 用统一语法查询约三十个生物医学数据源
- 免去逐个学习各数据源 API 与标识
- 跨库文献检索并自动去重
- 在基因、变异、药物、疾病间切换检索
- 为 AI 智能体提供标准 MCP 接入
适合
- 需要整合多源生物医学证据的研究场景
- 给 AI 智能体接入文献与临床试验数据
- 肿瘤基因变异与药物信息的检索分析
- 希望用命令行统一查询公开医学数据库
不适合
- 面向生物医学领域,通用业务场景不适用
- 数据源多为境外公开库,访问受网络影响
- 不提供临床诊断结论,仅做数据检索
- 结果需专业人员判读,不能直接用于决策
如何接入
- 以 MCP 服务器接入 Claude Code、Claude Desktop 等
- 支持 stdio 与 HTTP 两种运行方式
- 提供命令行与 PyPI、Homebrew、Docker 安装
- 接入 PubMed、ClinicalTrials.gov、ClinVar 等
- 可用 g:Profiler 做基因集富集
已知限制
- 数据源为境外公开库,国内访问可能延迟或受限
- 检索结果的准确性依赖上游数据源
- 专业性强,需生物医学背景判读
- 部分工作流需下载数据集到本地
接入与使用事实
- 部署方式
- 本地运行、自托管
- 实现语言
- Rust、Python
- 中文界面
- 待确认
- 中文文档
- 待确认
- 定价方式
- 开源
- 许可证
- 待确认
- 国内可达性
- 国内可达性待核验
- 可达性观察
- 待补充
权限、依赖与维护信号
这些字段记录公开可见信号,不等同于安全审计结论。
权限信号
暂无公开信号。
依赖信号
暂无公开信号。
维护信号
暂无公开信号。
公开来源与证据
- 代码仓库仅作事实索引
